与探源工程第四阶段的认识相比，探源工程第五阶段对古国时代文明内涵的认识更加深化。项目研究认为，大约从距今约5800年开始，中华大地上各个区域相继出现较为明显的社会分化，进入了文明起源的加速阶段，可将从距今5800年至距今3500年划分为古国时代和王朝时代两个时代。其中，古国时代第一阶段为距今5800-5200年前后，古国时代第二阶段在距今5200-4300年前后，古国时代第三阶段大体相当于距今4300-3800年前后。
同时，探源工程第五阶段实施以来，多学科协同研究不断推向深入。年代学研究重点解决了石峁皇城台、内城、外城空间布局的年代，并针对山西兴县碧村遗址的白灰地面开展测年方法研究，填补了国内技术空白；动物考古、植物考古、环境考古以及稳定同位素分析、古dna分析的协同研究显示，距今7000年以来生业经济反映出明显的区域差异，中原及北方地区显示出明显以粟为主，黍、大豆、水稻为补充的混合型农业生产体系；长江流域中下游地区发现的重要水田遗迹表明，不同的稻作农业模式与早期复杂社会结构存在共生关系；针对手工业方面的研究发现，大约在距今3800年前后，中原地区手工业生产技术发生了质变。
责任编辑：陈郡瑜